Introducción. Las enfermedades diarreicas siguen siendo una de las causas más importantes de mortalidad y morbilidad infantil en el mundo. Objetivo. Caracterizar los patógenos intestinales aislados  en el Laboratorio de Microbiología  del Hospital Gineco-obstétrico  Mariana Grajales  Cuello del 2006 al 2013. Método. Se realizó un estudio descriptivo retrospectivo con  el total de muestras heces fecales  procesadas en el laboratorio referido,  procedentes del Hospital Infantil José Luís Miranda. Resultados. Los géneros Shigella y Salmonellas  prevalecieron con el 36.35% y 27.22% respectivamente. Escherichia coli  enterohemorrágica, Aeromonas hidrophila, Yersisinia  enterocolitica, Vibrio chlerae, Escherichia coli enterotoxigénica  y Plesiomonas sp fueron aisladas en porcentajes que variaron de 13.18 a 0.78. En el año 2013  Vibrio  cholerae fue la bacteria  predomínate en un 46.24%. Los aislamientos bacterianos, en su mayoría,  fueron  más frecuentes en el segundo y tercer trimestre de  los años  estudiados pero  Yersinia enterocolitica     fue más frecuente en los   primeros  y cuartos trimestres. Shigella spp, Salmonella  y ECEH mostraron tendencia  a la disminución, mientras que Aeromonas hidrophila tuvo tendencia  al incremento en los aislmiento. Conclusiones. Shigella spp y Salmonella spp fueron las  principales   causas de diarreas en niños. Los   aislamientos bacterianos presentaron fluctuaciones con  mayor frecuentes  en los segundos y terceros trimestre, menos Yersinia enteroclitca  que predominó en los primeros y  cuartos trimestres. La  tendencia de los aislmientos   fue  a  la disminución en la mayoría  de ellos y  con un descenso  uniforme  de todos en el año 2013 que coincide  con la  aparición de  aislamientos  de Vibrio cholerae.